1.太平天国革命时期，白莲教起义军五大支即五大旗（黄、红、白、绿、黑）之一。曾在河北、山东一带进行反清活动，后与捻军会合抗击清军。

2.广西天地会起义军余部刘永福1866年组织的武装。以七星黑旗为军旗，故名。中法战争时英勇抗击法国侵略者，多次获胜。后清政府诱招刘永福，并不断裁减黑旗军人数。甲午中日战争爆发，调到台湾驻防。《马关条约》签订后，黑旗军和台湾各地义军顽强抵抗日本侵略者，除刘返回大陆外，其所部黑旗军全部牺牲。